Entrez数据库的数据类型介绍

更新时间:2024-05-15 10:01:01   人气:5845
Entrez是美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发和维护的一个综合性的生物学文献、分子序列以及各种相关生物医学数据的强大检索系统。它以其全面性与综合性,为全球科研人员提供了丰富的资源和服务。

在Entrez数据库中包含了多种不同类型的数据:

1. **PubMed**:作为 Entrez 数据库的重要组成部分之一, PubMed 主要收录了生命科学及临床医学领域的学术期刊论文摘要,并且部分记录还链接到全文内容或其他相关的网络资源。用户可以通过关键词搜索获取最新的研究进展或回顾历史研究成果。

2. **Nucleotide and Protein Databases (GenBank/RefSeq)**:这两个子数据库存储了大量的核酸(DNA/RNA) 和蛋白质序列数据。这些序列来源于全世界范围内的科学家提交的实验结果或者是通过测序项目产生的大量组学数据。它们对于基因功能分析、进化关系推断等具有极高的价值。

3. **Gene Database**: 提供关于已知所有物种特定基因的信息,包括其基本特性描述、定位及其编码蛋白的功能注释,还包括与其他数据库如OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man),UniProtKB之间的关联链接。

4. **PubChem Compound & PubChem Substance:** 这两个化学信息系统分别储存着经过验证的小分子结构实体资料和其他更广泛来源但不一定完全验证过的物质相关信息,服务于药物研发及其他涉及小分子的研究领域。

5. **Taxonomy database**: 该分类法数据库详细列出了各类生物种属间的关系层级以及相应的遗传学特征,方便研究人员对不同物种进行比较或者探讨某一类群的独特属性。

6. 其他还有诸如Structure (三维分子构象)、PopSet(群体遗传变异数据集)、 dbGaP(人类专题遗传数据中心),以及其他众多针对特殊应用设计的专业化数据库。

总之,Entrez系列数据库以其实时更新的大规模多学科交叉融合特点,在科学研究者探索未知世界的过程中扮演了极其关键的角色——无论是从基础的生命现象解析还是指向精准医疗的应用实践,都展现出了强大的支持力。通过对各类型数据的有效整合利用,极大推动了整个生物医药科技的发展进程。